Im Sommer 2015 wurde Martschinko vom deutschen Bundesligisten TSG 1899 Hoffenheim verpflichtet und sofort für ein Jahr mit der Option auf drei weitere Jahre an den FK Austria Wien ausgeliehen.
Am 14. Mai 2016 gab die Austria bekannt, dass bei dem von der TSG Hoffenheim ausgeliehen Linksverteidiger die Kaufoption gezogen wurde. Über die Ablösemodalitäten wurde Stillschweigen vereinbart. Martschinko wurde mit einem Vertrag bis Sommer 2019 ausgestattet.
Am 16.01.2019 gab die Austria bekannt, das der Vertrag mit dem Linksverteidiger vorzeitig, für weitere drei Jahre, bis Sommer 2022 verlängert wurde. Die Austria wollte damit auch ein Zeichen setzen und beweisen, dass harte Arbeit dementsprechend belohnt wird. Sportdirektor Ralf Muhr: „Diese vorzeitige Verlängerung ist für beide Seiten ein schönes Signal und zeigt, dass es sich nach einer schweren Verletzung lohnt, wenn man sich zurückkämpft.“ Martschinko verletzte sich im Oktober 2017 schwer im Kniegelenk (Kreuzbandriss) und konnte aufgrund langwieriger Probleme kein Spiel mehr machen. Nach diesem fast endlosen Leidensweg ist er jetzt wieder unmittelbar vorm Comeback.
Am 15. Februar 2022 gab die Austria bekannt, dass Christoph Martschinko nach Lettland wechselt. Nachdem alle Parteien den Transfer ordnungsgemäß bestätigt haben, wechselt Christoph Martschinko zum FC Riga, wo er auf Trainer Thorsten Fink trifft. Über die Ablösemodalitäten wurde Stillschweigen vereinbart.
Vereine:
SV Lebring (2000 - 2008), Red Bull Salzburg (2008 - 2014), SC Wr. Neustadt (Leihe 2012 - 2014), SV Grödig (2014 - 2015), TSG 1899 Hoffenheim (2015), Austria Wien (ab Sommer 2015 - Februar 2022), FC Riga (ab Februar 2022)
Legende:
E ... Einsätze
EW ... Einwechslungen
T+ ... Geschossene Tore
T- ... Tore erhalten (nur für Tormänner)
S ... Siege
U ... Unentschieden
N ... Niederlagen
G ... Gelbe Karten
GR ... Gelb-rote Karten
R ... Rote Karten
M ... Spielminuten
M/T+ ... Minuten pro geschossenes Tor
M/T- ... Minuten pro erhaltenes Tor (nur für Tormänner)