Franz Pfeifer begann beim Wiener Sport-Club mit dem Fußballspielen. Er wechselte danach für zwei Jahre nach Kapfenberg, ehe er 1960 zur Wiener Austria kam. Er war ein guter Techniker mit einem Bombenschuss. Spielte oftmals in der österreichischen Junioren- und UEFA-Auswahl.
Den größten Erfolg feierte er 1960 als er in der siegreichen Austriamannschaft stand, welche Rapid im Cupfinale mit 4:2 besiegte.
Hauptberuflich war Franz Pfeifer Angestellter in einem Zeitungsbetrieb (Kurier), wo er später auch Karriere machen sollte. Nach einer schweren Knieverletzung (Meniskus) bei der Austria musste er frühzeitig seine Fußballschuhe an den Nagel hängen.
Legende:
E ... Einsätze
EW ... Einwechslungen
T+ ... Geschossene Tore
T- ... Tore erhalten (nur für Tormänner)
S ... Siege
U ... Unentschieden
N ... Niederlagen
G ... Gelbe Karten
GR ... Gelb-rote Karten
R ... Rote Karten
M ... Spielminuten
M/T+ ... Minuten pro geschossenes Tor
M/T- ... Minuten pro erhaltenes Tor (nur für Tormänner)