Im Sommer 2000 beendete Toni Pfeffer seine erfolgreiche aktive Laufbahn nach 396 Meisterschaftsspielen für die Wiener Austria. Mit 4 Meistertitel, 4 Cupsiegen und 2 WM Teilnahmen war er einer der erfolgreichsten österreichischen Spieler der Neunziger.
Im August 2001 wurde er Trainer der Wiener Austria, mit Walter Hörmann bildete er das "Trainerduo". Diese Notlösung hatte jedoch nicht lange Bestand und endete bereits wieder im Dezember des gleichen Jahres.