Mag. Markus Kraetschmer studierte in Wien Betriebswirtschaft und wechselte 1997 von der Schoellerbank zur Austria. Als Manager war er Anfangs administrativer Leiter des Vereins, der gleichermaßen für die sportlichen und finanziellen Belange der Austria zuständig war.
Zum starken Mann bei der Austria wurde er jedoch erst nach dem Abgang von Toni Polster als Generalmanager im Juni 2005.
Am 27. Mai 2011 gab die Austria bekannt, dass der Vetrag von Markus Kraetschmer als Finanzvorstand bis Sommer 2016 verlängert wurde.
Am 14. Juni 2021 gab die Austria bekannt, dass der Vertrag von Markus Kraetschmer nicht mehr verlängert wird. Kraetschmer war seit 23 Jahren bei FK Austria Wien engagiert. Kraetschmer verlässt die Austria, um sich neuen Aufgaben und Herausforderungen zu widmen. Seine Aufgaben wurden von Vorstand Gerhard Krisch übernommen.